Применение метода посадки верхушек клубней картофеля дало значительную прибавку к урожаю, что было особенно важно во время войны. Всего весной 1942 года верхушки от продовольственных клубней картофеля были посажены в одной лишь Сибири на площади более 150 тысяч гектаров. Верхушки картофеля сажались не только в централизованных хозяйствах, но и на индивидуальных огородах рабочих, служащих, колхозников. В результате в стране в 1942 году дополнительный урожай картофеля составил не менее 200 тысяч тонн. Нелишне отметить, что картофель в то время применялся при изготовлении нитропороха, использовавшегося в запальном устройстве знаменитых "катюш", и имел, таким образом, не только пищевое, но и важное военное значение.
В 1943 году, за разработку и внедрение методики посадки картофеля верхушками клубней Т. Д. Лысенко и его коллегам была присуждена ещё одна Сталинская премия.
Как и в прошлый раз, Т. Д. Лысенко перечислил свою часть премии на нужды фронта. Так же поступили и его коллеги. От имени Верховного главнокомандующего И. В. Сталина им была послана телеграмма с благодарностью.
В 1942-43 гг. Лысенко проводил агротехнические исследования, которые ставили целью решение возникавших перед ним вопросов сельскохозяйственной практики. Так, он улучшил метод определения всхожести семян, что позволило быстрее принимать решение об их использовании или замене. Рекомендованный им зимой 1941/42 года способ анализа качества посевной партии требовал довольно много времени. "Образцы семян, взятые из партии для анализа, требовалось выдержать 10-15 дней при комнатной температуре и затем ещё 7 дней проращивать… Если процент всхожести анализированного образца оказывался низким, то это значило, что партия не годилась и её нужно заменить".
Лысенко и его коллегами был найден более быстрый и притом весьма простой способ определения степени всхожести семян. А именно, брались по 100-200 семян из среднего для посевной партии образца, им давалось набухнуть в воде, затем с зародышей иглой снимались семенные оболочки (либо зародыши прокалывались иглой или булавкой) и семена ставились на проращивание. Если зародыши были живыми и только находились в состоянии покоя, то после этой процедуры они сразу начинали прорастать. Такой анализ позволял быстро определить процент всхожих семян в посевной партии и принять решение: применять ли метод весеннего обогрева для ускорения дозревания семян или же заменять партию.
В условиях нехватки трактористов и горючего Т. Д. Лысенко предложил сеять озимые по стерне, утверждая, что остатки срезанных стеблей растений после уборки яровых будут способствовать задержанию снега и нормальному развитию растений. Хотя вначале предложение Лысенко было встречено с недоверием и даже с насмешками, оно оказалось полезным. Посевы по стерне озимой ржи дали немалую прибавку к урожаю, а также стали хорошим предшественником для последующих посевов яровой мягкой и твёрдой пшеницы.
После окончания войны агроприём посева по стерне нашёл применение и как метод борьбы с ветровой эрозией почв. Он применялся не только в СССР — в Сибири и Казахстане — но и в других странах. Позже, за дальнейшую разработку и внедрение этого приема в Казахстане А. И. Бараев с сотрудниками были удостоены Ленинской премии. Деятельным сторонником безотвальной обработки почвы был Ф. Т. Моргун, он настойчиво внедрял этот метод в 1980-2000-х гг., указывая, в числе других аргументов, на его широкое распространение в Канаде и США. Так что Т. Д. Лысенко во внедрении передовых агротехнических приёмов опережал своё время. Однако в 1940-х гг. предложенный им метод посева по стерне являлся, главным образом, способом получения дополнительного урожая.
Ещё одним важным достижением Т. Д. Лысенко в те годы стала разработка метода вегетативного размножения одного из каучуконосов — кок-сагыза, при котором (в отличие от размножения семенами) сохранялась способность этой культуры накапливать каучук.
В предвоенный период промышленность Советского Союза испытывала большую потребность в каучуке, который тогда добывался из растений-каучуконосов. В связи с этим вопросы их культивации, повышения объёма добычи, поиска новых каучуконосных растений регулярно ставились перед сельскохозяйственными организациями и их руководителями. Разработка академиком Т. Д. Лысенко метода вегетативного выращивания кок-сагыза лежала в направлении решения этих вопросов.
Наконец, предложенная Т. Д. Лысенко агротехника проса позволила создать перед войной значительные запасы этой важной крупяной культуры, которая прочно вошла в рацион советских воинов.
В июне 1945 года Т. Д. Лысенко было присвоено звание Героя Социалистического труда — наивысшая гражданская награда страны.
...Указ Президиума Верховного Совета СССР
О присвоении, звании Герои Социалистического Труда академику Лысенко Трофиму Денисовичу
За выдающиеся заслуги в деле развития сельскохозяйственной науки н поднятия урожайности сельскохозяйственных культур, особенно картофеля и проса, присвоить звание Герой Социалистического Труда с вручением Ордена Ленина и золотой медали «Серп и Молот» академику Лысенко Трофиму Денисовичу
Председатель Президиума Верховного Совета СССР М. КАЛИНИН.
Секретарь Президиума Верховного Совета СССР Д. ГОРКИН.